公司变更股权时，如果转让方是个人，那么需要按照“财产转让所得”项目来缴纳个人所得税。具体缴纳的个人所得税税额计算方式如下：

个人所得税应纳税额 = (股权转让收入 - 股权原值 - 合理费用) × 20%

其中，股权转让收入是指个人转让股权所取得的全部价款和价外费用；股权原值是指取得该股权时实际支付的价款或该股权的账面原值；合理费用则是指股权转让过程中按规定支付的税金、资产评估费、中介服务费等。

需要注意的是，这里的税率是固定的20%，适用于财产转让所得项目，包括股权转让所得。此外，在股权变更过程中，还可能涉及到其他税费，如印花税等，但印花税的计算方式与个人所得税不同，通常按照股权转让协议金额的一定比例（如万分之五）来计收。

对于公司来说，如果公司转让股权给其他公司或个人，那么涉及到的税费将更为复杂，可能包括企业所得税、增值税、契税等。具体税费的计算方式和税率将根据相关法律法规和税务部门的规定来确定。

此外，还需要注意的是，在计算个人所得税时，如果转让方无法提供完整的股权原值凭证或合理费用凭证，那么税务机关可能会采用核定征收的方式来确定应纳税额。核定征收的税率和计算方法将由税务机关根据具体情况来确定。

，公司变更股权时个人需要缴纳的个人所得税税额将取决于股权转让收入、股权原值、合理费用以及税务机关的核定情况。为了准确计算和缴纳个人所得税，建议咨询专业税务人员或律师以确保合法合规。